Las pepitas de calabaza son comestibles y se consumen asadas, especialmente en México y partes de Guatemala. Se preparan remojándolas en agua saturada de sal, y poniéndolas a tostar en un comal con sal. También se utilizan para preparar una variedad de mole conocido como pepián o pipián.

Dependiendo de como se preparen, y después de haber sido cocidas, las pepitas se presentan con cáscara o sin ésta.